超级丰富的病毒控制你的肠道细菌

时间:2018-01-13 08:34:24166网络整理admin

作者:Azeen Ghorayshi(图片来源:Getty Images / 3DClinic)普通感冒,丙型肝炎...... crAssphage一种新的病毒已经被发现,可能潜伏在世界上近四分之三的人的肠道中,使其成为你从未了解过的最普遍存在的病毒之一通过感染一种常见肠道细菌进行复制的病毒比其他所有已知肠道病毒的总量高六倍它的发现支持了这样一种观点,即病毒可能是我们肠子的傀​​儡主人,调节着叫我们肠道的大量细菌群落荷兰奈梅亨的Radboud大学医学中心的Bas Dutilh说:“我们的想法是,病毒可以控制肠道内的细菌水平,确保没有任何一种类型占据优势” “病毒可以维持我们内部的生物多样性”Dutilh说,病毒在很多不同的人身上发现,无论他们住在哪里或吃什么,都推翻了以前认为每个人的病毒签名都是独一无二的信念我们的病毒货物 - 统称为病毒体 - 因人而异的想法来自2010年的一项研究,该研究检查了双胞胎肠道细菌之间的相似性利用来自粪便样本的基因组数据 - 一个很好的代理,用于推断肠道内部正在发生的事情 - 来自四对双胞胎及其母亲,该研究发现,密切相关的个体中的肠道细菌与不相关的个​​体之间的相似性更为相似个人另一方面,病毒群落似乎变化很大 - 甚至在双胞胎之间也是如此但是有一个很大的警告:该组中只有19%的病毒体与我们已知病毒的数据库中的任何东西相匹配其余的,Dutilh说,是一个黑盒子,因为那里有大量未知的病毒,而且由于我们知道的病毒的快速发展这就是他所说的“生物暗物质”的领域 “其余的被忽略了,因为我们不知道他们是什么或他们做了什么,”他说 Dutilh和他在圣地亚哥州立大学的合作者决定重新调查数据,看看研究参与者是否分享了任何病毒性暗物质一种病毒 - 一种定殖细菌的病毒,称为噬菌体 - 存在于所有12个人的样本中当研究人员扩大他们的搜索范围以包括来自人类微生物组计划的所有数据时,他们发现同样的病毒存在于73%,这是一个大规模项目,用于测序生活在我们身体内和身体上的所有微生物的DNA在所有466个人类粪便样本中在他们用来发现它的DNA组装软件之后,他们发现了他们的名字crAssphage “我们在欧洲,亚洲和美国的样本中找到它,”Dutilh说 “一种解释是,它伴随着我们许多世代,与人类一起传播到世界各地但它也有可能在某些食物中随处可食“该团队能够证明crAssphage最可能的宿主是细菌Bacteroides,它是我们肠道中最常见的细菌之一拟杆菌与肥胖,糖尿病甚至结肠直肠癌等疾病有关,这表明该病毒也可能对这些病症产生影响但是,由于像crAssphage这样的病毒可以通过多种方式存在于细菌内,因此目前还不清楚它起什么作用不管是什么,Dutilh说,它突出了病毒体作为比细菌群落高一级控制机制的重要性他说,这可以用于个人噬菌体治疗,可以将特殊设计的噬菌体插入肠道以杀死或增加某些已经出错的细菌群体密歇根州圣路易斯华盛顿大学的亚历杭德罗·雷耶斯说:“这是一段非常短的时间,因为最近的技术发展使我们开始发现病毒世界所包含的巨大多样性”他参与了对这对双胞胎的病毒体研究 “现在的目标是了解这些病毒在其微生物群落中的作用,这些微生物群落基于它们的丰富性和多样性,必定是一个重要的病毒”“病毒体被忽视了10年的事实是大象在微生物组研究中,“Dutilh说 “大多数人只专注于细菌,但也有病毒,甚至真菌这是所有这些事物之间的相互作用和主机的真正重要“期刊参考:Nature Communications,DOI:10.1038 / ncomms5498关于这些主题的更多信息: